rocedimientos en Microbiología Clínica
Recomendaciones de la Sociedad Española de Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica
Editores: Emilia Cercenado y Rafael Cantón

Coordinadora: María Antonia Meseguer Peinado
Autores: Juana Begoña Cacho Calvo
María Antonia Meseguer Peinado
Antonio Oliver Palomo
Jorge Puig de la Bellacasa
ÍNDICE DEL DOCUMENTO CIENTÍFICO:
1. Introducción.

2. Consideraciones clínicas. Cuadros clínicos y agentes etiológicos.
2.1. Bronquitis
2.1.1. Bronquitis por Bordetella pertussis
2.1.2. Bronquitis por Mycoplasma pneumoniae
2.1.3. Bronquitis por Chlamydophila pneumoniae
2.2. Bronquiolitis
2.3. Neumonía aguda
2.3.1. Neumonía adquirida en la comunidad
2.3.1.1. Neumonía por Streptococcus pneumoniae
2.3.1.2. Neumonía por Haemophilus influenzae
2.3.1.3. Neumonía por Legionella pneumophila
2.3.1.4. Neumonía por Mycoplasma pneumoniae
2.3.1.5. Neumonía por Chlamydophila pneumoniae y otras clamidias
2.3.1.6. Neumonía por Moraxella catarrhalis
2.3.1.7. Neumonía por Enterobacteriaceae
2.3.1.8. Neumonía por Pseudomonas y otros bacilos gramnegativos no fermentadores
2.3.1.9. Neumonía por aspiración
2.3.2. Neumonía en el paciente inmunodeprimido
2.4. Neumonía nosocomial
2.4.1. Neumonía en el paciente sin ventilación mecánica
2.4.2. Neumonía en el paciente con ventilación mecánica
2.5. Colonización-infección respiratoria crónica
2.5.1. Neumonía crónica
2.5.1.1. Neumonía por Nocardia spp.
2.5.1.2. Neumonía por Rhodococcus equi
2.5.1.3. Neumonía por Burkholderia pseudomallei
2.5.1.4. Neumonía por Propionibacterium propionicum
2.5.2. Enfermedad pulmonar obstructiva crónica (EPOC)
2.5.3. Bronquiectasias
2.6. Absceso pulmonar
2.7. Derrame pleural y empiema

3. Tipos de muestras y recogida de muestras
3.1. Muestras obtenidas por procedimientos no invasivos
3.1.1. Frotis del tracto respiratorio superior
3.1.2. Esputo. Esputo inducido
3.1.3. Broncoaspirado /aspirado traqueal /secreciones respiratorias
3.1.4. Hemocultivos
3.1.5. Orina
3.1.6. Suero
3.2 Muestras obtenidas por procedimientos invasivos
3.2.1. Mediante fibrobroncoscopia
3.2.1.1. Lavado bronquial
3.2.1.2. Cepillado bronquial
3.2.1.3. Lavado broncoalveolar
3.2.1.4. Biopsia transbronquial
3.2.1.5. Aspiración transbronquial con aguja
3.2.2. Mediante otras técnicas no fibrobroncoscópicas
3.2.2.1. Técnicas ciegas
3.2.2.2. Aspiración transtraqueal
3.2.2.3. Biopsia por punción transtorácica
3.2.2.4. Biopsia a pulmón abierto
3.2.2.5. Punción pleural
3.3. Tipos de muestras indicados en relación con el cuadro clínico
3.4. Tipos de muestras indicados en relación con los diferentes agentes etiológicos
4. Transporte y conservación de la muestra.

5. Manejo de la muestra a la recepción en el laboratorio de microbiología.

6. Procesamiento de la muestra. Selección de los medios de cultivo y condiciones de incubación.
6.1. Criterios microscópicos de validez del esputo para su posterior cultivo
6.2. Cultivos cualitativos
6.3. Cultivos cuantitativos en muestras obtenidas por fibrobroncoscopia
6.4. Cultivos cuantitativos en muestras obtenidas por procedimientos no invasivos
6.5. Cultivos en medios especiales
6.5.1 Legionella spp.
6.5.2. Bordetella spp.
7. Criterios para la interpretación de los resultados. Información de los resultados.
7.1. Muestras contaminadas con microbiota del tracto respiratorio superior
7.2. Muestras no contaminadas con microbiota del tracto respiratorio superior
7.3. Cultivos cuantitativos en muestras obtenidas por fibrobroncoscopia
8. Técnicas de diagnóstico rápido.
8.1. Determinación de antígenos bacterianos en orina (S. pneumoniae y L. pneumophila)
8.2. Métodos moleculares
8.3. E-test directo en muestras de pacientes con neumonía asociada a ventilación mecánica
9. Procedimientos no aceptables
10. Procedimientos adicionales a realizar en situaciones especiales.
10.1. Neumonía por bacterias del orden Rickettsiales (R. prowazekii, C. burnetii)
10.2. Infección neumónica por Francisella tularensis
11. Bibliografia.
DOCUMENTOS TÉCNICOS:
1. PNT-ITRI-01. Procesamiento de las muestras respiratorias obtenidas por procedimientos no invasivos

2. PNT-ITS-2. Cultivo cuantitativo del lavado broncoalveolar

3. PNT-ITS-3. Cultivo cuantitativo del cepillo bronquial protegido

4. PNT-ITS-4. Procesamiento de muestras para cultivo e identificación de bordetella spp

5. PNT-ITS-5. Técnica rápida para la detección de antígeno de Stretococcus pneumoniae en orina para el diagnóstico de las infecciones respiratorias

6. PNT-ITS-6. Antibiograma por etest directo en muestras respiratorias de pacientes con neumonía asociada a ventilación mecánica