rocedimientos en Microbiología Clínica Recomendaciones de la Sociedad Española de Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica Editores: Emilia Cercenado y Rafael Cantón

Coordinador: Antonio Oliver Autores: Teresa Alarcón Estrella Caballero Rafael Cantón Antonio Oliver

ÍNDICE DEL DOCUMENTO CIENTÍFICO: 1. Introducción 2. Consideraciones clínicas y microbiológicas de la colonización/infección broncopulmonar crónica en la fibrosis quística 2.1. Patogénesis de la colonización/infección broncopulmonar 2.2. Cronoinfección broncopulmonar en la fibrosis quística 2.3. Principales microorganismos implicados en la colonización/infección broncopulmonar crónica 2.3.1. Pseudomonas aeruginosa 2.3.2. Staphylococcus aureus 2.3.3. Haemophilus influenzae 2.3.4. Streptococcus pneumoniae 2.3.5. Burkholderia cepacia complex 2.3.6. Stenotrophomonas maltophilia, Achromobacter spp. y otros bacilos Gram negativos no fermentadores 2.3.7. Enterobacteriaceae 2.3.8. Mycobacterium spp. 2.3.9. Nocardia spp. 2.3.10. Aspergillus y hongos levaduriformes 2.3.11. Virus respiratorios 2.3.12. Clamidias, micoplasmas y otras bacterias atípicas 3. Tipos de muestras, recogida, transporte y conservación 4. Valoración y manejo de las muestras en el laboratorio de microbiología 5. Procesamiento de las muestras respiratorias para cultivo cuantitativo 5.1. Finalidad y justificación del cultivo cuantitativo 5.2. Medios de cultivo y condiciones de incubación 5.3. Consideraciones generales para la identificación de los agentes etiológicos en el contexto de la fibrosis quística 5.4. Identificación de Burkholderia cepacia complex 5.5. Estudio de la sensibilidad y la resistencia a los antibióticos sobre colonias aisladas 5.5.1. Pseudomonas aeruginosa 5.5.2. Otros microorganismos 5.5.3. Estudio de la sensibilidad a los antibióticos en biofilms 6. Interpretación e información de los resultados 6.1. Cultivos cuantitativos secuenciales en muestras respiratorias 6.1.1. Definición de los estadios de colonización/infección 6.1.2. Seguimiento microbiológico de la colonización/infección crónica 6.2. Interpretación e información del aislamiento de B. cepacia complex 6.3. Estudios de sensibilidad y resistencia a los antibióticos 7. Técnicas rápidas de diagnóstico. 7.1. Detección de P. aeruginosa y otros patógenos en muestras respiratorias por métodos moleculares 7.2. Técnicas para el estudio directo de la sensibilidad y la resistencia a los antibióticos 7.2.1. Etest directo sobre las muestras respiratorias 7.2.2. Siembra cuantitativa en medios con antibióticos 8. Procedimientos adicionales a realizar en situaciones especiales 8.1. Técnicas moleculares para la identificación de bacilos Gram negativos no fermentadores 8.2. Técnicas de epidemiología molecular para el seguimiento de la colonización/infección broncopulmonar crónica 8.3. Diagnóstico serológico en el contexto de la fibrosis quística 8.3.1. Detección de anticuerpos frente a Aspergillus 8.3.2. Detección de anticuerpos frente a Pseudomonas aeruginosa 8.3.3. Detección de anticuerpos frente a Mycobacterium spp. 9. Bibliografía DOCUMENTOS TÉCNICOS: 1. PNT-FQ-1. Cultivo cuantitativo de muestras de esputo en pacientes con fibrosis quística 2. PNT-FQ-2. Estudio de la sensibilidad a antibióticos de Pseudomonas aeruginosa procedentes de pacientes con fibrosis quística 3. PNT-FQ-3. Cultivo e identificación de Burkholderia cepacia complex 4. PNT-FQ-4. Detección de anticuerpos frente a Pseudomonas aeruginosa