Procedimientos en Microbiología Clínica Recomendaciones de la Sociedad Española de Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica Editores: Emilia Cercenado y Rafael Cantón

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Coordinador: José Elías García Sánchez Autores: Inmaculada García García Fernando García Garrote José Elías García Sánchez Isabel Sánchez Romero

ÍNDICE DEL DOCUMENTO CIENTÍFICO: 1. Introducción 2. Microbiota habitual del tracto digestivo 3. Proceso microbiológico general de las infecciones intraabdominales 3.1 Obtención de las muestras 3.1.1 Líquido peritoneal 3.1.2 Bilis 3.1.3 Líquido efluente 3.1.4 Exudados purulentos y abscesos 3.1.5 Biopsias y tejidos 3.1.6 Prótesis biliares 3.1.7 Hemocultivos 3.1.8 Otras muestras con valor diagnóstico 3.2 Transporte y conservación 3.3 Recepción de la muestra 3.4 Procesamiento de la muestra 3.4.1 Examen macroscópico de la muestra 3.4.2 Pretratamiento de las muestras 3.4.3 Extensiones para la tinción de Gram 3.4.4 Inoculación 3.5 Medios de cultivo e incubación 3.6 Conservación de las muestras 3.7 Interpretación de los resultados 3.7.1 Tinción de Gram 3.7.2 Cultivos 3.7.2.1 Medios incubados en aerobiosis y atmósfera de CO2 3.7.2.2 Medios incubados en anaerobiosis 3.7.2.3 Medios líquidos 3.8 Información de resultados 3.8.1 Tinción de Gram 3.8.2 Cultivos 4. Peritonitis y abscesos intraperitoneales 4.1 Introducción y clasificación 4.2 Peritonitis primarias 4.2.1 Peritonitis bacteriana espontánea 4.2.1.1 Introducción 4.2.1.2 Etiopatogenia 4.2.1.3 Cuadro clínico 4.2.1.4 Diagnóstico microbiológico 4.2.2 Peritonitis tuberculosa 4.2.2.1 Introducción 4.2.2.2 Etiopatogenia 4.2.2.3 Cuadro clínico 4.2.2.4 Diagnóstico microbiológico 4.3. Peritonitis secundaria 4.3.1 Introducción 4.3.2 Etiopatogenia 4.3.3 Cuadro clínico 4.3.4 Diagnóstico microbiológico 4.4. Peritonitis terciaria 4.4.1 Introducción 4.4.2 Etiopatogenia 4.4.3 Cuadro clínico 4.4.4 Diagnóstico microbiológico 4.5 Abscesos intraperitoneales 4.5.1 Introducción 4.5.2 Etiopatogenia 4.5.3 Cuadro clínico 4.5.4 Diagnóstico microbiológico 5. Infecciones relacionadas con la diálisis peritoneal 5.1 Introducción y clasificación 5.2 Etiopatogenia 5.2.1 Infecciones relacionadas con el catéter 5.2.2 Peritonitis 5.3 Cuadro clínico 5.3.1 Infecciones relacionadas con el catéter 5.3.2 Peritonitis 5.4 Diagnóstico microbiológico 5.4.1 Recogida de la muestra 5.4.1.1 Infecciones relacionadas con el catéter 5.4.1.2 Peritonitis 5.4.2 Transporte y conservación de la muestra. 5.4.3 Procesamiento de la muestra 5.4.4 Lectura e identificación 5.4.4.1 Tinción de Gram 5.4.4.2 Cultivos 5.4.5 Interpretación de resultados 5.4.5.1 Infecciones relacionadas con el catéter 5.4.5.2 Peritonitis 5.4.6 Otros procedimientos 5.4.7 Información de resultados 6. Abscesos de vísceras intraabdominales 6.1 Introducción y tipos 6.2 Absceso hepático 6.2.1 Introducción 6.2.2 Etiopatogenia 6.2.3 Cuadro clínico 6.2.4 Diagnóstico microbiológico 6.3 Absceso pancreático y necrosis pancreática infectada 6.3.1 Introducción 6.3.2 Etiopatogenia 6.3.3 Cuadro clínico 6.3.4 Diagnóstico microbiológico 6.4 Absceso esplénico 6.4.1 Introducción 6.4.2 Etiopatogenia 6.4.3 Cuadro clínico 6.4.4 Diagnóstico microbiológico 6.5 Abscesos suprarrenales 6.5.1 Introducción 6.5.2 Etiopatogenia 6.5.3 Cuadro clínico 6.5.4 Diagnóstico microbiológico 7. Infección de las vías biliares 7.1 Introducción y clasificación 7.2 Etiopatogenia 7.3 Cuadro clínico 7.4 Diagnóstico microbiológico 8. Apendicitis y diverticulitis 8.1 Introducción y tipos 8.2 Etiopatogenia 8.3 Cuadro clínico 8.4 Diagnóstico microbiológico 9. Infecciones retroperitoneales 9.1 Introducción y tipos 9.2 Abscesos del espacio retroperitoneal 9.2.1 Introducción 9.2.2 Etiopatogenia 9.2.3 Cuadro clínico 9.2.4 Diagnóstico microbiológico 9.3 Abscesos del psoas 9.3.1 Introducción 9.3.2 Etiopatogenia 9.3.3 Cuadro clínico 9.3.4 Diagnóstico microbiológico 10. Bibliografía DOCUMENTOS TÉCNICOS: 1. PNT-IIA-01. Procesamiento microbiológico del líquido peritoneal 2. PNT-IIA-02. Procesamiento microbiológico de las muestras obtenidas de pacientes con infecciones asociadas a diálisis peritoneal 3. PNT-IIA-03. Procesamiento microbiológico de los abscesos intraabdominales 4. PNT-IIA-04. Procesamiento microbiológico de las muestras de origen biliar: líquido biliar, biopsias y materiales protésicos