rocedimientos en Microbiología Clínica
Recomendaciones de la Sociedad Española de Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica
Editores: Emilia Cercenado y
Rafael Cantón
Coordinador:
Fernando Alcaide Fernández de Vega
Autores:
Fernando Alcaide Fernández de Vega
Jaime Esteban Moreno
Julián González Martín
Juan José Palacios Gutiérrez
ÍNDICE DEL DOCUMENTO CIENTÍFICO:
1. Introducción
2. Consideraciones microbiológicas.
3. Clasificación y consideraciones clínicas.
3.1. Complejo
Mycobacterium tuberculosis
.
3.2.
Mycobacterium leprae
.
3.3. Micobacterias no tuberculosas de crecimiento lento.
3.4. Micobacterias no tuberculosas de crecimiento rápido.
3.5. Otras micobacterias no tuberculosas.
4. Muestras: selección, recogida, transporte y conservación.
4.1. Elección de la(s) muestra(s).
4.2. Muestras respiratoras.
4.3. Sangre.
4.4. Líquidos estériles (cefalorraquídeo, articular, peritoneal, pleural, pericárdico, etc.).
4.5. Tejidos (biopsias).
4.6. Orina.
4.7. Heces.
5. Microscopía.
5.1. Tinciones.
5.2. Sensibilidad y especificidad.
5.3. Observación microscópica.
5.4. Interpretación y expresión de los resultados.
5.5. Falsos resultados.
6. Pretratamiento de las muestras: digestión y descontaminación.
7. Cultivo.
7.1. Medios sólidos.
7.2. Medios bifásicos.
7.3. Medios líquidos.
7.4. Condiciones de incubación.
8. Identificación.
8.1. Identificación fenotípica.
8.2. Identificación cromatográfica.
8.3. Identificación molecular.
9. Detección directa de
Mycobacterium tuberculosis
en la muestra clínica.
9.1. Sistemas de amplificación comerciales.
9.2. Sistemas de amplificación caseros.
9.3. Micobacteriófagos.
10. Pruebas de determinación de la sensibilidad.
10.1. Pruebas de sensibilidad en
Mycobacterium tuberculosis
.
10.2. Pruebas de sensibilidad en micobacterias no tuberculosas de crecimiento lento.
10.3. Pruebas de sensibilidad en micobacterias no tuberculosas de crecimiento rápido.
11. Epidemiología molecular.
11.1. Epidemiología molecular de
M. tuberculosis
.
11.2. Epidemiología molecular.
12. Estructura, dotación y seguridad del laboratorio de micobacterias.
12.1. Niveles de los laboratorios de micobacteriología.
12.2. Bioseguridad en el laboratorio de micobacterias.
13. Bibliografía.
DOCUMENTOS TÉCNICOS:
1. Tinción de Ziehl-Neelsen.
2. Digestión y descontaminación de las muestras clínicas con N-acetil-L-cisteína e hidróxido de sodio para el cultivo de micobacterias.
3. Cultivo de micobacterias en medio sólido de Löwenstein-Jensen.
4. Cultivo de micobacterias en medios líquidos mediante sistemas automatizados.
5. Identificación fenotípica de las micobacterias
6. Identificación de micobacterias mediante cromatografía líquida de alta presión (HPLC).
7. Identificación molecular de micobacterias mediante PCR-RFLP del gen
hsp65
(PRA).
8. Detección directa de
Mycobacterium tuberculosis
en muestras clínicas mediante amplificación genómica (PCR de la
IS6110
).
9. Pruebas de sensibilidad en
Mycobacterium tuberculosis
mediante el método de las proporciones en agar.
10. Pruebas de sensibilidad en
Mycobacterium kansasii
a los fármacos de primera línea mediante el sistema Bactec 460.
11. Pruebas de sensibilidad en micobacterias de crecimiento rápido mediante microdilución en caldo.
12. Epidemiología molecular de
Mycobacterium tuberculosis
mediante spoligotyping.
13. Epidemiología molecular de
Mycobacterium tuberculosis
mediante RFLP de la
IS6110
(ver documento técnico PNT-MMT-02 en el Procedimiento nº 18 de los Procedimientos en Microbiología Clínica, SEIMC. 2ª Edición).